سمینار کارشناسی ارشد برق پیشگویی ساختار پروتئین ها به کمک کنترل فازی

اختصاصی از نیک فایل سمینار کارشناسی ارشد برق پیشگویی ساختار پروتئین ها به کمک کنترل فازی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

این محصول در قالب پی دی اف و 60 صفحه می باشد.

این سمینار جهت ارائه در مقطع کارشناسی ارشد رشته مهندسی برق-کنترل طراحی و تدوین گردیده است . و شامل کلیه مباحث مورد نیاز سمینار ارشد این رشته می باشد.نمونه های مشابه این عنوان با قیمت های بسیار بالایی در اینترنت به فروش می رسد.گروه تخصصی ما این سمینار را با قیمت ناچیزی جهت استفاده دانشجویان عزیز در رابطه با منبع اطلاعاتی در اختیار شما قرار می دهند. حق مالکیت معنوی این اثر مربوط به نگارنده است. و فقط جهت استفاده ازمنابع اطلاعاتی و بالابردن سطح علمی شما در این سایت ارائه گردیده است.

چکیده

در این تحقیق به بررسی کنترل فازی در تعیین ساختار پروتئین ها می پردازیم. ابتدا ساختار چهار گانه پروتئین ها معرفی شده است ساختار اول توالی اسیدهای آمینه به عنوان اجزای سازنده پروتئین در یک زنجیره پلی پپتیدی معرض می شود. ساختار دوم پروتئین ها را ساختار موضعی یا نظم در یک بعد نیز می گویند ساختار سوم پروتئین همان شکل کروی و به هم فشرده آن است و ساختار چهارم به بررسی جایگری و شکل زیر واحدهای ساختاری پروتئین می پردازد.

در ادامه کنترل کننده های فازی به عنوان روشی برای توصیف پدیده های نامشخص و همراه عدم قطعیت معرفی شده است از آنجا که دنیای بیوانفورماتیک بسیار پیچیده تر از آن است که بتوان آن را بطور دقیق توصیف و مدل کرد و عملکرد آن را بدست آورد. بنابراین با یک مدل تقریبی یا همان فازی که قابل قبول و قابل تجزیه و تحلیل باشد به پیشگویی ساختار پروتئین ناشناخته و جدید می پردازیم و به دنبال این هستیم که بالاترین شباهت را بین پروتئین ناشناخته و یک پروتئین که از قبل آن را می شناختیم بدست آوریم.

مقدمه

بیوانفورماتیک علم استخراج دانش از منابع داده ای بیولوژیکی به کمک آنالیزهای کامپیوتری است از آنجا که منابع اطلاعاتی موجود در بیوانفورماتیک همراه با عدم قطعیت همراه است.معمولاً اطلاعات آن خام و بعضاً نادقیق بوده است از این رو کنترل فازی روش مؤثر جهت مقابله با عدم قطعیتها و رسیدن به اطلاعات کاملتر ودقیق تر در اختیار قرار می دهد. در نتیجه به کمک روش فازی به مدل سازی این عدم قطعیت ها پرداخته و یک پیشگویی دقیق تر ارائه خواهد شد.

فصل اول

کلیات

1-1) هدف

رشد انفجاری اطلاعات بیولوژیکی نیازمند استفاده از تکنیکهای محاسباتی به منظور نگهداری، سازماندهی و آنالیز ا ین اطلاعات می باشد. نیاز به استخراج دانش از میان انبوه اطلاعات خام شیوه های جدید کامپیوتری را طلب می کند در این میان پیش گویی ساختار پروتئین ها یکی از چالش های اساسی بیولوژیکی ملکولی می باشد.

مسأله پیشگویی ساختار پروتئین ها در علوم داروسازی و برای طراحی دا روهای جدید حائز اهمیت بوده است و از صرف گزافی که برای تعیین ساختار پروتئین ها با روش های تجربی هزینه می گردد جلوگیری می کند در داروسازی برای طراحی داروهای مختلف هزاران ماکرو ملکول مختلف مورد آزمون قرار می گیرد که تعیین ساختار همه آنها کاری غیر عملی و بسیار هزینه بر می باشد لذا پیشرفت در زمینه پیش گویی ساختار پروتئین ها راه را برای طراحی داروهای جدید هموار می سازد و هزینه های تحقیقاتی را صدها برابر کاهش می دهد. با توجه به سرمایه گذاری اخیر در صنایع داروسازی در کشور اهمیت این مساله در جهت پیشبرد این دانش و فن اوری غیر قابل انکار می نماید هدف این تحقیق طراحی و پیاده سازی الگوریتم جدید بر اساس منطق فازی جهت پیشگویی و بدست آوردن میزان شباهت بین دو رشته پروتئینی است که این کار در پیشگویی رفتار یک پروتئین ناشناخته که تعیین توالی شده است ولی هنوز تعیین ساختار نشده است و همچنین در بدست آوردن ساختارهای دوم و سوم و چهارم و کمک به کاهش عدم قطعیت آنها می تواند بسیار موثر باشد همچنین پروتئین ناشناخته ای که بالاترین میزان شباهت را با یک پروتئین شناخته شده دارد در بسیاری از کاربردها خواص عملکردی مشابه پروتئینی شناخته دارد.

2-1) پیشینه تحقیق

تا کنون در جهان رویکردهای مختلفی و الگوریتم های متعددی جهت پیشگویی هرچه دقیق تر ساختار پروتئین ها ارائه شده است و در طول تقریباً 20 سال گذشته این رویکردها موفق به بهبود حدوداً 20 درصدی دقت پیشگویی شده اند سه راهکار اصلی برای پیشگویی ساختار پروتئین ها مطرح می باشد که مبین بر روشهای چو ضمن – گور، شبکه عصبی و نزدیکترین همسایگی می باشد . هدف از این سمینار بالا بردن میزان اطمینان و در نتیجه بهبود پیشگویی به کمک بدست آوردن بیشترین شباهت بین پروتئینها است این روش می تواند به عنوان یک عامل کمکی هم راه با روشهای فوق الذکر به پیشگویی ساختار یا عملکرد بهتر (توسط یکی از روشهای فیوژن یا ترکیب اطلاعات) منجر گردد.

دانلود تحقیق ریاضیات و پیشگویی آینده

اختصاصی از نیک فایل دانلود تحقیق ریاضیات و پیشگویی آینده دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

بشر از روزگاران گذشته، تاکنون، دوست داشته که آینده را پیشگویی کند. مخصوصا پیشگویی در مورد آب و هوا، زلزله، قیمتها،بازاربورس، سودسهام، اقتصاد برایش بسیار ارزنده بوده است.
انسان سعی می‌کند، با استفاده از روشهای گوناگون، برای کنترل زندگی خود به پیشگویی بپردازد. اما آیا همه‌ی این پیشگویی‌ها در مورد پدیده‌های مختلف قابل اطمینان است؟ آیا همه‌ی اتفاقات طبیعی دارای قابل پیشگویی هستند؟ آیا آنها دوره‌ی تناوب دارند؟
طی سالها، دانشمندان علوم مختلف با تکیه بر‌وجود‌الگوهای متناوب تئوریهایی بیان کرده، و قانونهای کلی وضع نموده‌اند.
اما تئوری اغتشاش دنیای علوم را به لرزه انداخته است. به تدریج فیزیکدانها و دانشمندان دیگرهم به طور جدی تئوری اغتشاش را پذیرفته‌اند. و آنها نیز به ناچار باور کرده‌اند، که از اتفاقات ساده‌ی دنیای ما گرفته، تا پدیده‌های مهم و پیچده‌ی جهان، فرمولها و قانونهایی که طی قرنها مورد استفاده بوده‌اند، همیشه قادر به توضیح آنچه که پیش خواهد آمد. نیستند هر چند که پذیرفتن این اصل نا‌امید‌کننده است، ولی امروزه باید دانشمندان علوم مختلف، تمام مهارتهای ریاضی و آگاهی‌های خود را بکار برند. تا تشخیص بدهند، که اغتشاش چه زمانی در محدوده‌ی مورد نظر آنها خود را نشان خواهد‌داد.
داستان اغتشاش از سال 1960شروع شد. در این سال یک هواشناس به نام «ادوارد ‌لورنز» آزمایش بسیار ساده ای با استفاده از کامپیوتر، در مورد صعود هوای گرم انجام داد. کشف مهم او این بود، که اختلاف‌جزیی در صورت مسئله، باعث ایجاد تفاوت بزرگی در پاسخ آن می‌شود. یعنی اغتشاش به وقوع می‌پیوندد.این مطلب در هوا‌شناسی اثر پروانه‌ای نامیده می‌شود.

دلیل انتخاب این نام را می‌توان چنین توضیح داد، که بال‌زدن پروانه (تغییر‌کوچک) در یک گوشه‌ی جهان ممکن است، باعث ایجاد اغتشاش کوچکی در هوا شود. این تغییرات بیشتر و بیشتر شده، و به طوفانی سهمگین در گوشه‌ی دیگر جهان تبدیل گردد. اغتشاشات جزیی در مطالعات هواشناسی مرتبا به وقوع می‌پیوندند، و چون امکان ثبت تمام تغییرات کوچک و ساده وجود ندارد، به همین دلیل اثرکلی آنها در آب و هوای جهان قابل پیش‌بینی نیست، و به همین سبب پیشگویی اداره‌ی هواشناسی غالباّ غلط از آب در می‌آید. زیرا این خطاهای کوچک در اطلاعات ورودی ممکن است به تدریج بیشتر و بیشتر اثرگذار باشد، و باعث ایجاد اغتشاش شود.
«لورنیز» با رسم نمودار نتایج آزمایش خود در سه بعد، اولین نمایش هندسی ازعلم اغتشاش را به وجود‌آورد. این نمودار یک منحنی مارپیچ سه بعدی است. که در آن خطوط همدیگر را قطع نکرده، و روی هم نمی‌افتد. این منحنی را «نمودار اغتشاش لورنز» می‌نامند.

نمودار تئوری اغتشاش را می‌توان در فضای چند بعدی رسم کرد. این نمودار مرتباّ پیچ می‌خورد، اما هرگز دقیقاّ تکرار نمی‌شود. نظریه‌ی لورنز، و منحنی او به سال 1963در مجله‌ی علوم هواشناسی منتشر شد. متاسفانه در آن زمان دانشمندان علوم دیگر به آن توجهی نکردند، و این از سال 1970به بعد بود، که به تدریج دانشمندان علوم دیگر شروع به کشف نتایج مشابه، به ویژه هنگام استفاده از کامپیوتر، برای پردازش داده‌هاکردند. این مطالعات درحوزه‌های مختلفی انجام می‌گرفت، که به نظر می‌رسید هیچ رابطه‌ای با هم ندارند.

فایل ورد 7 ص

پیشگویی ساختار پروتئین ها به کمک کنترل فازی

اختصاصی از نیک فایل پیشگویی ساختار پروتئین ها به کمک کنترل فازی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

چکیده

در این تحقیق به بررسی کنترل فازی در تعیین ساختار پروتئین ها می پردازیم. ابتدا ساختار چهار گانه پروتئین ها معرفی شده است ساختار اول توالی اسیدهای آمینه به عنوان اجزای سازنده پروتئین در یک زنجیره پلی پپتیدی معرض می شود. ساختار دوم پروتئین ها را ساختار موضعی یا نظم در یک بعد نیز می گویند ساختار سوم پروتئین همان شکل کروی و به هم فشرده آن است و ساختار چهارم به بررسی جایگری و شکل زیر واحدهای ساختاری پروتئین می پردازد.

در ادامه کنترل کننده های فازی به عنوان روشی برای توصیف پدیده های نامشخص و همراه عدم قطعیت معرفی شده است از آنجا که دنیای بیوانفورماتیک بسیار پیچیده تر از آن است که بتوان آن را بطور دقیق توصیف و مدل کرد و عملکرد آن را بدست آورد. بنابراین با یک مدل تقریبی یا همان فازی که قابل قبول و قابل تجزیه و تحلیل باشد به پیشگویی ساختار پروتئین ناشناخته و جدید می پردازیم و به دنبال این هستیم که بالاترین شباهت را بین پروتئین ناشناخته و یک پروتئین که از قبل آن را می شناختیم بدست آوریم.

فهرست مطالب:

چکیده.......................................................................................................................................................................... 1
مقدمه........................................................................................................................................................................... 2
فصل اول : کلیات................................................................................................................................................... 3
1 هدف............................................................................................................................................................ 4 -1
2 پیشینه تحقیق.......................................................................................................................................... 5 -1
3روش کار و تحقیق..................................................................................................................................... 5 -1
فصل دوم : ساختار پروتئین ها ........................................................................................................................ 7
1-2 مقدمه ....................................................................................................................................................... 8
2-2 نیروهای غیر کووالان در ساختار پروتئین .............................................................................. 11
1-2-2 بر همکنش های الکتروستاتیک............................................................................................. 12
2-2-2 بر همکنش واندروالز................................................................................................................... 12
3-2-2 پیوندهای هیدورژنی................................................................................................................... 13
4-2-2 بر همکنش های آب گریز........................................................................................................ 14
5 نقش آب در سلول..................................................................................................................... 14 - 2-2
6-2-2 اسیدهای آمینه گوناگون............................................................................................................ 16
ح
3-2 ساختار پروتیئنی............................................................................................................................... 17
1-3-2 ساختار اول..................................................................................................................................... 17
1-1-3-2 آرایش فضایی در زنجیره پلی پپتین.............................................................................. 19
2ساختار دوم.................................................................................................................................... 21 -3-2
1-2-3-2 مارپیچ ها .................................................................................................................................. 21
2-2-3-2 صفحات تا خوردة بتا............................................................................................................ 22
3-3-2 ساختار اولیه فرا ثانویه............................................................................................................. 25
4-3-1 ساختار سوم ............................................................................................................................... 25
5-3-2 ساختار چهارم............................................................................................................................ 27
4-2 پروتئین های مرتبط به هم از نظر تکاملی.............................................................................. 27
1-4-2 روش های مختلف تعیین ساختار پروتئین ها.................................................................. 28
4-2-2 پیش بینی و طراحی ساختار پروتیئن................................................................................. 28
فصل سوم : سیستم های فازی...................................................................................................................... 30
1مقدمه........................................................................................................................................................ 31 -3
2-3 سیستم های فازی چگونه سیستم هایی هستند؟................................................................ 32
3-3 مجموعه فازی..................................................................................................................................... 33
1-3-3 تعریف مجموعه فازی................................................................................................................. 33
2-3-3 نمایش توابع تعلق....................................................................................................................... 33
4-3 عملیات روی مجموعه های فازی................................................................................................ 34
5 پایگاه قواعد و ساخت موتور استنتاج......................................................................................... 36 -3
1 ترکیب ممدانی............................................................................................................................. 36 - 5-3
ط
فصل چهارم : پیاده سازی پیشگویی ساختار پروتئین ها با استفاده از کنترل فازی................. 37
1 مقدمه ...................................................................................................................................................... 38 -4
2-4 بدست آوردن ماکزیمم شباهت و پیشگویی ساختار پروتئین.......................................... 38
3-4 پیاده سازی روش ........................................................................................................................... 41
فصل ششم : نتیجه گیری وپیشنهادات........................................................................................................... 43
1نتیجه گیری..................................................................................................................................................... 44 -6
2پیشنهادات...................................................................................................................................................... 44 -6
منابع و ماخذ............................................................................................................................................................. 45
-1 فهرست منابع فارسی......................................................................................................................................... 46
-2 فهرست منابع لاتین........................................................................................................................................... 46
-3 سایت های اطلاع رسانی.............................................................................................................................. 47
چکیده انگلیسی...................................................................................................................................................... 48